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Des fermentations in vitro dans des bioréacteurs seront réalisées après optimisation des paramètres (pH, temps de résidence…) grâce aux données collectées dans la littérature sur les caractéristiques du syndrome de l’intestin irritable. Les fermenteurs seront inoculés avec du microbiote fécal provenant de sujets présentant un syndrome du côlon irritable (3 répétitions avec selles de 3 sujets différents). Nous adapterons également si nécessaire le milieu nutritif qui sera introduit dans les bioréacteurs. Les fermentations dureront 21 jours. Des échantillons seront prélevés régulièrement dans la phase atmosphérique et dans le milieu de fermentation pour analyser la composition du microbiote (séquençage et/ou qPCR et son activité métabolique: production de gaz, d’acides gras à chaîne courte et d’autres métabolites potentiels. Les résultats obtenus in vitro seront comparés aux données in vivo collectées dans la littérature (en particulier pour la composition du microbiote et l’activité métabolique), afin de valider le modèle.
Guy Rousseau
Université Clermont Auvergne
Life Sciences
Education
Université de Montréal
Globalink Research Award
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