Explorer un nouveau mécanisme de codage des protéines et de formation d’ADN recombinant via les cercles d’ADN extrachromosomique

Des preuves de l’existence d’ADN circulaire (eccDNA) ont été présentées il y a des décennies, mais ce n’est que récemment que les scientifiques ont vraiment commencé à comprendre comment ces eccDNA fonctionnent. Cependant, les études actuelles basées sur des technologies de séquençage à lecture courte ont des limites dans l’accès à la précision et dans l’abondance de la population réelle d’eccDNA. Ce projet s’appuie sur la base de données eccDNA haute précision à lecture unique et récemment généré au laboratoire du Professeur Vanderschuren en utilisant la technologie de séquençage à lecture longue (PacBio). Notre objectif est de bénéficier des dernières plateformes protéomiques établies au laboratoire Uhrig de l’Université de l’Alberta qui permettront la quantification et la découverte de protéines et peptides non annotés auparavant. Le projet fournira la première base de données eccDNA à lecture unique, une base de données de protéome, une CIDER technologie pour les utilisateurs et un potentiel de partenariat université-industrie.

Faculty Supervisor:

Richard Glen Uhrig

Student:

Partner:

Université de Liège

Discipline:

Life Sciences

Sector:

Education

University:

University of Alberta

Program: