Ana Pinson a parcouru 2 000 milles à la recherche de réponses d’une fraction de centimètre de large.
Étiré, l’ADN d’une cellule humaine mesure environ trois mètres de long, mais seulement environ deux nanomètres (0,0000002 centimètres) de large.
Pinson est entre sa troisième et sa quatrième année d’études en sciences génomiques à l’Université nationale autonome du Mexique (NAUM). Situé à Mexico, le plus grand centre métropolitain de l’hémisphère occidental, NAUM est la plus grande école postsecondaire du pays.
Son inscription est comparable à la population de Londres.
Pinson étudie à l’Université Western pour l’été la génétique du cancer du sein dans le cadre d’un échange par l’entremise de Mitacs Globalink, un programme financé par le gouvernement fédéral conçu pour promouvoir le secteur universitaire canadien dans le monde entier.
Elle a dit qu’elle aime le campus relativement calme à Western, et l’été relativement frais à Londres.
« J’aime beaucoup les gens parce qu’ils sont très gentils et j’aime le campus », a-t-elle déclaré. « J’aime les bâtiments. Je pense que c’est très calme et très agréable d’être ici à Londres.
Pinson prévoit d’obtenir un doctorat en sciences biomédicales et de travailler comme chercheur. Elle a dit que Western est sur sa liste d’endroits pour obtenir sa maîtrise.
Elle fait à peu près le même travail sur le cancer du sein qu’au Mexique, mais la différence à Western est qu’elle travaille avec des données humaines provenant d’échantillons de cancer du sein, pas seulement des bactéries.
« Le domaine qui m’intéresse le plus aujourd’hui est la recherche humaine, c’est donc l’occasion pour moi de m’impliquer dans cela », a-t-elle déclaré. « Je m’intéresse généralement à la médecine génomique parce que je pense que c’est un domaine très excitant. Il se concentre davantage sur la prévention des maladies (plutôt que sur) le traitement des maladies.
Sous la supervision de l’étudiant diplômé John Mucaki, Pinson travaille avec des données générées par un séquenceur d’ADN, une machine « très coûteuse » prend une semaine à la fois pour prendre de minuscules photos d’un brin d’ADN, générant des images de millions de gènes au cours de chaque session.
Lorsque la machine a fini de traiter les images (ce qui prend encore deux jours), Mucaki et Pinson extrapolent complètement les données, en regardant différentes parties du séquençage de l’ADN sur lesquelles la plupart des chercheurs ont tendance à se concentrer.
Ils essaient de trouver quelque chose que d’autres ont manqué. Cette semaine, par exemple, le séquenceur traite des échantillons de femmes ayant des antécédents familiaux de cancer du sein et qui l’ont contracté elles-mêmes, mais le laboratoire n’a pas pu comprendre ce qui l’a causé.
« Nous recherchons des différences intéressantes dans leur ADN d’une personne en bonne santé pour trouver ce qui pourrait être à l’origine du cancer. »
Le projet de Pinson pour l’été est de développer un logiciel qui rendra le processus plus rapide, plus facile et plus flexible.
« Avec les progrès du séquençage, lorsque nous séquençons, nous générons tellement d’informations qu’il faut plus de temps pour les analyser que pour préparer et faire fonctionner la machine », a déclaré Mucaki. « C’est quelque chose qui sera très utile pendant des années. »
Peter Rogan, professeur de biochimie et d’informatique, titulaire d’une chaire de recherche du Canada de niveau I en bioinformatique génomique, supervise les travaux de Pinson.
Mitacs a communiqué avec Rogan pour l’échange de cette année parce qu’il a également accueilli un étudiant l’an dernier. Quand il a vu les qualifications de Pinson, il a pensé qu’elle serait un bon ajustement pour le travail en cours dans son laboratoire.
Étant donné qu’il n’y a que deux départements de génomique à part entière au Canada (à Toronto et à Vancouver), trouver des étudiants ayant cet objectif spécifique peut être un défi.
« Il y a une poignée de laboratoires orientés vers la génomique dans le département de biochimie de l’Ouest, de sorte que la plupart des étudiants formés là-bas n’ont pas nécessairement les compétences dont j’ai besoin pour développer mon laboratoire », a-t-il déclaré. « Le département de biochimie existe depuis le tournant du 20e siècle. Il est peu probable que nous changions le système. L’échange est donc l’occasion de réunir des étudiants qui ont la formation appropriée pour les laboratoires qui ont besoin de cette formation.
M. Rogan a indiqué que les étudiants de premier cycle qui s’entraînent dans le cadre des échanges de Mitacs en apprennent davantage, sont plus précieux et plus productifs au moment où ils atteignent le niveau des études supérieures.
Rogan est actuellement sur un échange de son propre, travaillant sur un projet de recherche sur le cancer du sein à la Fondazione IRCCS Istituto Nazionale dei Tumori à Milan.
Atteint alors qu’il était assis à 100 mètres du Colisée de Rome, il a déclaré que la collaboration internationale est l’avenir de la science.
« Le cancer du sein ne connaît pas de frontières nationales. »
Par Craig Gilbert
Partager la publication :
